Marko Valtonen aloitti harmonikansoiton Keijo Lounan johdolla Liedossa vuonna 1979. Hän jatkoi opintojaan Sibelius-Akatemian nuorisokoulutuksessa 1982 opettajinaan Heidi Velamo ja Matti Rantanen. Valtonen opiskeli Sibelius-Akatemian solistisella osastolla pääaineenaan harmonikka ja sivuaineinaan cembalo ja piano vuoteen 1998, jolloin hän valmistui musiikin maisteriksi. Hänen opettajinaan toimivat prof. Matti Rantanen, harmonikka, Kati Hämäläinen, cembalo ja Jarmo Eerikäinen, piano. Vuonna 2003 Valtonen syvensi harmonikansoiton opintojaan Trossingenin valtiollisessa musiikkikorkeakoulussa, Saksassa, prof. Hugo Nothin johdolla. Vuonna 2023 hän aloitti yhteistyön kehoterapeutti ja psyykkinen valmentaja Saara Sahrmanin kanssa. Siitä alkaen Sahrman on ollut Valtosen henkilökohtainen valmentaja.

Vuodesta 1999 Valtonen on ollut Turun seudun musiikkiopiston harmonikansoiton opettajan toimessa. Turun seudun musiikkiopiston ja Turun konservatorion yhdistyttyä hän jatkaa nyt opetustyötään Turun konservatorion harmonikansoiton lehtorina.

Valtosen ohjelmistossa on teoksia 1600-luvulta oman aikamme musiikkiin. Barokkimusiikilla ja erityisesti Johann Sebastian Bachin musiikilla on aina ollut erityinen paikka hänen ohjelmistossaan. Valtosen soittamisissa suuren sijan ovat saaneet myös ranskalainen musette- ja chansonperinne sekä suomalainen ja argentiinalainen tango. Lisäksi hän on soittanut useissa teatterituotannoissa, kuten Evita, Les Misérables, West Side Story, Amélie ja The Last Ship. Hän on konsertoinut laajalti sekä solistina että eri kamarimusiikkikokoonpanoissa kotimaan lisäksi Pohjoismaissa ja Keski-Euroopassa.

Valtosen vuoden 2026 konserttiohjelmistossa on barokin ajan italialaisia ja espanjalaisia vaikutteita. Säveltäjäniminä ovat Domenico Scarlatti, Johann Sebastian Bach ja Remo Giazotto.